Az elektronikus kereskedelemhez kapcsolódó alkalmazások és eszközök fejlesztésével foglalkozó ISS Group az MFG/PRO-hoz integráltan kapcsolódó szoftvercsomagja web alapú üzleti tevékenység folytatásához kínál ún. business-to-business, illetve business-to-consumer megoldásokat. Az egyik révén a vállalatok beszállítóikkal, disztribútoraikkal és más üzleti partnereikkel szorosabb kapcsolattartást valósíthatnak meg az interneten keresztül, míg a másik megoldás az internetes áruház kialakítását teremti meg MFG/PRO és ISS Group-alapokon. A KFKI Isys-ISS Group megállapodás révén több mint 30 hazai MFG/PRO alkalmazó vállalat juthat e-commerce-hez.

Az KFKI Isys másik partneri megállapodása révén az amerikai Robocom cég raktárirányítási rendszerét (RIMS) vehetik birtokba a hazai felhasználók, biztosítva az anyagfolyamatok felügyeletét a különböző típusú raktárak és termékféleségek szállítási és tárolási sajátosságait figyelembe vevő megoldással.