A Microsoft januárban, az új Intel-alapú Mac gépek megjelenésekor már bejelentette, hogy a Virtual PC jelenlegi verziója nem kompatibilis ezekkel. Mivel a szoftver szorosan kapcsolódik a korábbi, Power-alapú Mac hardverhez, az új számítógépekhez egy teljesen más alkalmazás kidolgozására lenne szükség. Ilyenek azonban egyre nagyobb számban bukkannak fel más gyártóktól, mint például az Apple saját, Boot Camp nevű PC-virtualizációs szoftvere, vagy a Parallels Desktop termék, amelyek ráadásul észrevehetően gyorsabbak is, mint a Virtual PC. A Microsoft álláspontja szerint az ilyen és hasonló megoldások, egy teljes Windows operációs rendszerrel kiegészítve, abszolút mértékben kielégítik a felhasználók azon igényeit, hogy Windows-alapú alkalmazásokat futtathassanak Intel-alapú Mac számítógépükön.

A Microsoft a bejelentéshez azt is hozzáfűzte, hogy a jelenlegi Virtual PC felhasználók számára továbbra is biztosítják a szoftverhez a terméktámogatást.