A magasabb órajellel hajtott processzor azonban több energiát igényel és több hőt termel. A keletkezett hő elvezetését és ezzel a CPU lapka hatékony hűtését az Area-51 ALX tervezői nagy hatásfokú vízes hűtőrendszerrel oldották meg, amely hátlapra szerelt radiátort foglal magába. A vízhűtés 4,00 GHz-en is biztosítja a megengedettnél nem magasabb üzemi hőmérsékletet. A hűtést a felügyelő rendszer írányítja.

A nagyobb teljesítményért azonban a felhasználónak többet kell fizetnie. Anévlegesnél magasabb órajellel működő processzort és a vízhűtést tartalmazó PC-k ára jóval magasabb, mint a hagyományos komponenseket tartalmazó társaiké. Az Area-51ALX induló ára Intel Core 2 Extreme QX9650 processzorral 4599 dollár, míg a 4,00 GHz-es QX9770 processzorral 5509 dollár. Ezek a konfigurációk még 1 GB ATI Radeon HD 3870 X2 grafikus kártyát (2 GB DDR3 memóriával, 1 TB tárolókapacitást (2x500 GB-os merevlemezes meghajtó RAID-0 elrendezésben), kétrétegű DVD-írót, 1200 W-os tápegységet és előre telepített Windows Vista Home Premium operációs rendszert foglalnak magukba.