Prim Hírek

A Német Rákkutatási Központ (Deutsches Krebsforschungszentrum, DKFZ) a rák kialakulásának folyamatát vizsgálja, és a rosszindulatú folyamatokat beindító kockázati tényezőket keresi. A központban dolgozó tudósok tudományosan megalapozott új koncepciókat alakítanak ki a diagnosztika és a kezelés területén. Az IBM szuperszámítógép a DKFZ nagykapacitású adatközpontjában működik, különböző bio-számítástechnikai célokra használják. A részben belső fejlesztésű alkalmazásokkal például az emberi géntérképet elemzik, és szimulációkkal vizsgálják, hogy a különböző gyógyszerek mennyire hatásosak a rák ellen. Az IBM rendszer immár két eServer pSeries 690 szervert foglal magában, amelyek 64 POWER 4 processzort és további IBM POWER 3 processzorokat tartalmaznak, összteljesítménye 330 GFLOPS. Ez másodpercenként 330 milliárd műveletet jelent.

A DKFZ első IBM szuperszámítógépét már 1994-ben üzembe helyezték, négy éves lízingszerződések keretében pedig folyamatosan bővítették. A DKFZ kutatói nem nélkülözhetik a számítógépes kapacitás folyamatos növelését, mert egyre komplexebb szimulációkat végeznek, amelyek még ezeken a nagy teljesítményű rendszereken is több hétig eltarthatnak. A kutatók például a Gaussian, a TurboMol, a Molpro és az Amber nevű programot használják. Ezek többek között a molekulák szerkezetét és mozgását szimulálják. Az emberi genom és fehérjék szerkezeti elemzésének eredményeit különböző, a DNS- és fehérjeszekvenciákat tároló adatbázisokban rögzítik, illetve nemzetközi együttműködés keretében rendszeresen kicserélik más kutatóintézetekkel.

A rákkutatási intézetben a szükséges teljesítmény megvalósításának előfeltétele, hogy 64 bites számítógépeket, és az ezzel járó nagy címteret használják. Az alkalmas rendszer kiválasztásakor a DKFZ fő szempontjai között az ár/teljesítmény arány és a kis hőleadásés áramfelvétel szerepelt.

• A Német Rákkutatási Központot (DKFZ) 1964-ben, Heidelbergben hozták létre, Baden-Württenberg tartomány közcélú alapítványaként. A DKFZ országos kutatóintézet, 1977 óta tagja a német kutatóintézetek Hermann von Helmhotzról elnevezett társaságának (Hermann von Helmholtz-Gemeinschaft deutscher Forschungszentren, HGF), valamint a Német Tudományos Társulatnak (DFG) (Deutschen Forschungsgemeinschaft). A DKFZ működésének anyagi feltételeit főképpen a szövetségi oktatási és kutatási minisztérium (90%-ban) és a baden-württembergi tudományos, kutatási és művészeti minisztérium (10%-ban) fedezi. Az alapítvány célja, hogy hozzájáruljon a rák kialakulási mechanizmusának és kockázati tényezőinek alaposabb megértéséhez. Alapkutatásainak eredményei várhatóan új eredményekre vezetnek a rák megelőzése, diagnózisa és kezelése terén.